Das iPhone Duo bringt eine neue Button-Anordnung mit sich, die Nutzer anpassen müssen. Die Lautstärketasten befinden sich nun auf der Oberseite, und ihre Funktion variiert je nach Ausrichtung des Geräts. Apple bietet eine dynamische Anpassung der Tastenbelegung an, die in den Systemeinstellungen aktiviert werden kann.
Zusätzlich fehlt eine dedizierte Aktionstaste zum Stummschalten. Nutzer können stattdessen den Vibrationsalarm über das Kontrollzentrum aktivieren. Ein erzwungener Neustart erfolgt über eine spezifische Tastenkombination, die ebenfalls neu erlernt werden muss.